Das Baumeister Labor
ist Teil des Instituts für Biologie 3 der Albert-Ludwigs Universität in Freiburg/Breisgau.
Ralf Baumeister ist ein Mitglied:
der Fakultät für Biologie
der Fakultät für Medizin
des Exzellenzclusters BIOSS (Centre of Biological Signalling Studies)
des Exzellenzclusters CIBSS (Centre for Integrative Biological Signaling Studies)
der Exzellenz-Graduiertenschule SGBM (Spemann Graduiertenschule der Biologie and Medizin)
des internationalen M.Sc. Programms IMBS (International Master in Medical and Biological Sciences der Univ. Freiburg und Buenos Aires, Argentinien). Außerdem ist er Mitglied des NCL Netzwerks (der privaten Stiftung mit dem Namen National Contest for Life, die sich dem Kampf gegen erbliche neurodegenerative Erkrankungen bei Kindern verschrieben hat).
Lehre:
Wir leisten Beiträge zur Lehre in folgenden Bereichen:
Biologie (B.Sc. und M.Sc. Module)
Bioinformatik
Biologie für Mediziner
Biologie für Zahnmediziner
Molekulare Medizin
Internationales Masterprogram in Medical and Biological Sciences
Umfassende Informationen zum Lehrprogramm der Fakultät für Biologie finden sich hier.
Forschung:
Unsere Arbeitsgruppe beschäftigt sich mit der funktionellen Analyse von Genen im Kontext von Alterung und alterungsbedingten Krankheiten. Als Modell benutzen wir sowohl den Nematoden Caenorhabditis elegans (C. elegans) als auch humane Zelllinien. Dadurch können wir die funktionelle Charakterisierung einzelner Gene bzw. kompletter genetischer Netzwerke mit biochemischen Analysen der zugehörigen Proteine ergänzen. Wo immer es von Vorteil ist, stellen wir auch die Hefe als Modell in unseren Dienst. Neben diesen genetischen und biochemischen Herangehensweisen setzen wir schließlich pharmakologische Tests ein um die exakte Funktion der Proteine und deren Interaktionen im lebenden Organismus bestimmen zu können.
Die von uns bisher mit Hilfe des C. elegans Modells identifizierten Mechanismen haben sich bemerkenswert ähnlich auch in Säugetieren zeigen lassen und haben somit einen Beitrag zum Verständnis der Funktion krankheitsrelevanter humaner Gene geleistet.
Unser Forschungsschwerpunkt sind Gene mit Beteiligung an den Insulin/IGF- und mTOR-Signalwegen, der Parkinson’schen Krankheit und im Kontext der Stressantwort und Endomembrandynamik (Endocytose, Exocytose, Mitophagie, Autophagie).
Finanzierung:
Die Universität Freiburg
Das Land Baden-Württemberg: “Qualitätsoffensive-Programm”
Das Labor ist Mitbegründer des aus Landesmitteln finanzierten Zentrums für Biosystemanalyse (ZBSA).
DFG (Deutsche Forschungsgemeinschaft)
SFB1381 Dynamic Organization of the protein machineries: from Biogenesis and modular assembly to function
BIOSS – Centre for Biological Signalling Studies, Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
CIBSS – Centre for Integrative Biological Signaling Studies
BMBF (Bundesministerium für Bildung und Forschung)
Nationales Genomforschungsnetz (NGFN)
Kollaborationen mit der Pharmazeutischen Industrie
Graduiertenkollegs
GRAKO 1104 From cells to organs: Molecular mechanisms of Organogenesis
SGBM Spemann Graduate School of Biology and Medicine
IMBS International Master in Medical and Biological Sciences
IRTG Integrated Research Training Group of CRC850
is part of the Institute for Biology 3 of the Albert-Ludwig University in Freiburg/Breisgau, Germany.
Ralf Baumeister is member of:
Faculty of Biology
Faculty of Medicine
BIOSS Cluster of Excellence (Centre of Biological Signalling Studies)
CIBSS (Centre for Integrative Biological Signaling Studies)
SGBM (Spemann Graduate School of Biology and Medicine)
IMBS (International Master in Medical and Biological Sciences, Univ. of Freiburg and Buenos Aires, Argentina
He is also member of the scientific network of NCL (the private foundation National Contest for Life (NCL) to fight hereditary neurodegenerative diseases of childhood).
Teaching:
The lab and its members contribute to teaching in
Biology (B.Sc. and M.Sc. modules)
Bioinformatics
Biology for Medical Students
Biology for Students of Dental Medicine
Molecular Medicine
International Master program in Medical and Biological Sciences
Info on the teaching program of the Faculty of Biology can be found here
Research:
Our lab focuses on the functional analysis of genes involved in aging and age-related diseases. To combine the characterization of gene function and the dissection of entire genetic pathways with a biochemical understanding of the proteins, our models include the nematode Caenorhabditis elegans (C. elegans) and human cell culture. In addition, we use yeast models to answer specific questions whenever it is advantageous. Biochemical analyses and pharmacological assays to test chemical interference with protein function are performed to understand, in addition to the genetic details, the precise role of a protein and its physical interactions in a living organism.
So far, all of the mechanisms that we have identified using C. elegans models have been shown to be remarkably similar in the mammalian organism, and have helped a lot to understand the biological function of the human gene that is dysfunctional in disease.
We currently focus on genes involved in insulin/IGF and mTOR signaling, as well as genes implicated in Parkinson’s Disease, intracellular dynamics, and the cellular and intracellular/mitochondrial responses to nutrient and stress.
Funding:
The lab is currently funded by
The University of Freiburg
The State of Baden-Württemberg “Qualitätsoffensive-Programm“
The lab is founding member of ZBSA, the Center for Systems Biology funded by the State of Baden-Württemberg.
The German Research Council (DFG Deutsche Forschungsgemeinschaft)
CIBSS – Centre for Integrative Biological Signalling
SFB1381– Dynamic Organization of Cellular Protein Machineries: From Biogenesis and Modular Assembly to Function
BIOSS – Centre for Biological Signalling Studies, Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
BMBF (Federal Ministry of Education and Research)
(NGFN) National Network for Genome Research
Collaborations with the Pharmaceutical Industry
Graduate schools
GRAKO 1104 From cells to organs: Molecular mechanisms of Organogenesis
SGBM Spemann Graduate School of Biology and Medicine
IMBS International Master in Medical and Biological Sciences
IRTG Integrated Research Training Group of CRC850
